一、出自姬姓，為石碏之后裔。春秋時康叔的6世孫衛靖伯有個孫子叫公孫碏，字石，又稱石碏，是衛國的賢臣。衛桓公二年，其弟州吁驕奢被桓公撤去將軍之職，出奔國外。十幾年后，州吁領著黨徒潛回國內，刺死桓公，自立為君。石碏之子厚也參與了密謀，被拜為大夫。后石碏把州吁和石厚騙到陳國，又暗中給陳桓公寫了一封密信，信上說："衛國褊小，老夫耄矣，無能為也。此二人者，實弒寡君，敢即圖之。"所以，州吁到陳國后，立即被抓了起來，后來，石碏命人殺州吁、石厚于陳，然后迎立桓公之弟公子晉為國君。《春秋》稱贊石碏說："石碏純臣也，惡州吁而厚與焉，大義滅親，其是之謂乎？"厚的兒子駘仲，以祖父的字命氏，稱石氏。史稱石姓正宗。

二、據《唐書》所載，為"昭武九姓"之一。當時祁連山北昭武城（在今甘肅省臨澤縣境內）有康居國，后為匈奴擊敗，遷至中亞阿姆、錫爾兩河流域，成立了康、安、曹、石、米、何、史、火、尋、戊地等九個小國，稱為"昭武九姓"。唐高宗永徽年間，九姓先后歸附內地。其中有石氏。石國故地在今烏茲別克斯坦塔什干一帶。

三、 南北朝時鮮卑族復姓所改。據《魏書·官氏志》載，北魏有代北三字姓烏石蘭氏，進入中原后改為單姓石氏。又據《后趙錄》載有冉閔改姓石氏為石閔。《北史》載，婁氏有改姓石氏。